為了進一步加快商務領域科學發展，促進外經外貿轉型升級，根據省財政廳、商務廳《關于調整專項資金結構加快商務領域科學發展的指導意見（2010-2012）》、《江蘇省財政廳 江蘇省商務廳關于印發江蘇省商務發展專項資金支持外經貿轉型升級實施細則的通知》，南京市財政局、市商務局、市投促委共同制定了《南京市支持外經貿轉型升級商務發展專項資金管理辦法》。
　　 《辦法》規定了南京市支持外經貿轉型升級商務發展專項資金主要用于扶持開拓國際市場、自主品牌建設、出口基地建設、進出口信用保險、進出口公平貿易、對外投資和經濟合作、外經貿轉型升級業務培訓等。為更好地服務企業，《辦法》明確，對政府部門或機構統一組織或重點推進的項目，不需要企業申報就能確定費用補助金額的，由項目主管部門（機構）提供撥付依據和清單，財政局、市商務局、市投促委聘請獨立第三方機構對項目進行審計后直接下達。同時，將對專項資金管理使用情況采取不定期形式對專項資金實行跟蹤檢查，切實做好追蹤問效工作。