《加工貿易合同聯網審批系統》是中國國際電子商務中心受商務部委托開發、應用于我國加工貿易領域的電子政務信息網絡系統，是我國外經貿信息化建設工程的重要組成部分之一。該系統利用計算機網絡技術實現了對加工貿易合同及相關領域的標準化、規范化、科學化、網絡化管理，構建起全國統一的加工貿易企業及政府應用網絡支撐體系。
    現行加工貿易電子聯網審批管理系統分為企業端和審批端系統，前者供加工貿易企業進行合同申請，后者供各級加工貿易審批管理機關審批使用。兩個端的系統均分為C/S和B/S兩種形式。
    系統企業端包括合同的申請、變更、內銷、核銷以及作廢，不作價合同的申請和變更等功能模塊，涵蓋了加工貿易業務流程中的主要環節。合同申請的主要內容包括進口料件、出口成品、進口料件單耗、國產料件、國產料件單耗、國外廠商和加工企業等信息。企業可以根據合同的實際情況按要求進行填寫，并進行合法性檢查，通過檢查功能，可以大大減小企業合同錯誤填寫的幾率，從而提高合同申報乃至審批的效率。企業還可以在軟件中將合同進行上報，并等待審批結果，并最終獲得批準證號碼直至打印出合同批準證。當前正在使用的客戶端包括JM2000、JM WEB和JM2003系統，其中JM2003系統是在2003年全新設計和編碼的軟件，采用了一些最新的技術，并與實際業務結合緊密。
    系統審批端包括對企業合同、內銷合同以及不作價設備申請的查看，審批的功能。可以為企業打印合同批準證。當前正在使用的系統包括JM2003電子聯網審批系統和JM WEB聯網審批系統。二者近期都按照最新的業務流程進行了改造，可以滿足最新的業務需求。
    系統運用 CA 證書、電子鑰匙等技術，充分保證了數據的安全性和用戶身份的合法性。該系統的開通不但為企業與各級業務主管機關架起業務溝通的橋梁，更為我國加工貿易數據及時匯總、加強政府宏觀調控提供了有力的工具。